Após perderem a mãe, os jovens irmãos Edward e Alphonse Elric tentam trazê-la de volta à vida através da técnica proibida da transmutação humana. O ritual dá terrivelmente errado: Edward perde o braço direito e a perna esquerda, enquanto Alphonse tem todo o seu corpo destruído, tendo sua alma fixada a uma armadura de ferro. Decididos a recuperar seus corpos originais, os irmãos partem em uma jornada épica em busca da Pedra Filosofal, desvendando uma gigantesca conspiração militar que ameaça a nação de Amestris.